杀菌的主要对象是肉毒芽孢螺旋杆菌,此种菌能产生对人体造成致命伤害的毒素,其属耐热性厌氧菌,在121℃环境中三分将钟将失去生物活性,在100℃环境中6个小时左右失去生物活性。当然,温度越高,该病菌存活时间越短。经科学检测,在121℃时杀菌较为适宜,此时包装物有很好的耐热性,而且食品口感也较为良好。121℃杀菌时,食品中心F值达到4,食品中就不会检测出肉毒芽孢螺旋杆菌,达到了商业无菌的要求。

食品在高温环境下,时间越长口感越差,营养流失越多,这就要求杀菌锅内各点在升温时温度必须迅速达到一致,保持各点F值高度一致,这样才能迅速结束杀菌过程。降温也要迅速,以便使食品在尽量短的时间内脱离高温环境,这就要求杀菌锅的水流设计要科学合理,有限度的减少杀菌时间。